目前大部分税务机关在增值税发票抵扣都严格要求“三流一致”，其政策依据是国税发[1995]192号（国家税务总局关于加强增值税征收管理若干问题的通知）第一条第三款：纳税人购进货物或应税劳务，支付运输费用，所支付款项的单位，必须与开具抵扣凭证的销货单位、提供劳务的单位一致，才能够申报抵扣进项税额，否则不予抵扣。（按照税务局人士理解，即为虚开）因此，单从税务角度而言，如果票据开给总公司，付款也由总公司支付，东西也发给总公司，分公司只是单纯签署一个合同，那么风险不是很大。