分支机构的生产经营收入由公司总部统一结算，由于分支机构有参与具体的实施，也就是说，该分支机构通过生产经营活动取得了经济利益，产生了应纳税收入，只不过由于企业内部的核算及风险防范的要求，而将应税收入人为的集中到了总部，但并没改变收入归属的性质与地点。因此，分支机构应为增值税纳税义务人，纳税地点应为分支机构税务登记地，与企业收入具体核算地点、是独立或是非独立核算并无关系。如果全部是分支机构实施的则按照合同全部收入申报缴纳增值税，如果是部分参与，在合同中明确分支机构部分参与的比重/程度，按照相应比例申报，申报金额建议和当地税务机关进一步确认。