出口货物发生退运的，出口企业须向主管退税机关申请开具《出口货物退运已补税（未退税）证明》。企业携其到海关申请办理出口货物退运手续。已申报免抵退税的出口货物发生退运，出口企业应在退运发生的次月增值税纳税申报期内用负数申报冲减原免抵退税申报数据，并按现行会计制度的有关规定进行相应调整。因此，如果不再出口（无论贵司是如何处理的），那么需要在次月的出口退税系统中冲减退运部分的收入，具体计算以系统为准。