根据《中华人民共和国增值税暂行条例实施细则》单位或者个体工商户的下列行为，视同销售货物： (一)将货物交付其他单位或者个人代销; (二)销售代销货物; (三)设有两个以上机构并实行统一核算的纳税人，将货物从一个机构移送其他机构用于销售，但相关机构设在同一县(市)的除外;… 因此，如果是跨县(市)的分支机构，那么增值税上需要按照视同销售处理，因此不能按照成本处理